RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 LAMP2P13473 410 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TSPAN31Q12999 210 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 SLAMF1Q13291 335 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ARL5BQ96KC2 179 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 GPX5O75715 221 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 KCNK2O95069 426 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 AK1P00568 194 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 LRG1P02750 347 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 PGAM2P15259 253 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 GNALP38405 381 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 OR2L3Q8NG85 312 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 COL4A6Q14031 1691 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 CHP2O43745 196 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TGFB1P01137 390 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 HBQ1P09105 142 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 SPARCP09486 303 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 C1SP09871 688 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 HLA-EP13747 358 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 FPR3P25089 353 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TAS2R43P59537 309 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 BATFQ16520 125 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 RDH10Q8IZV5 341 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM163Q8TC26 289 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 KLK1P06870 262 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 DLSTP36957 453 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ARL4DP49703 201 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 PSPHP78330 225 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 SP3Q02447 781 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TCTE1Q5JU00 501 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 TEX19Q8NA77 164 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 NANPQ8TBE9 248 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 LRRC46Q96FV0 321 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 KCNJ15Q99712 375 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF649Q9BS31 505 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 MS4A8Q9BY19 250 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 MFFQ9GZY8 342 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TVP23AA6NH52 213 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 ADAM12O43184 909 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 GABRA5P31644 462 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 LRRC32Q14392 662 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 SSX1Q16384 188 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-205ENST00000397611 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 MGAMO43451 1857 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 A0A0G2JMP0 313 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-205ENST00000397611 MTX2O75431 263 aa5.11□□□□□ -1.59
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