RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 COX18Q8N8Q8 333 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC9A6Q92581 669 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RIT1Q92963 219 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DGAT2Q96PD7 388 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 APOL4Q9BPW4 351 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP21Q9H596 190 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FGF21Q9NSA1 209 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL3Q9UH77 587 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.57□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ADAMTS20P59510 1910 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZAR1LA6NP61 321 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PATE3B3GLJ2 98 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HRKO00198 91 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC1A7O00341 560 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 KLF4O43474 513 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PRAMEF2O60811 474 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 UGT2B17O75795 530 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CYP7B1O75881 506 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 LYPD3O95274 346 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DDAH2O95865 285 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV1D-16P01601 117 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 THY1P04216 161 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CFIP05156 583 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SYPP08247 313 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CYC1P08574 325 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HTR1AP08908 422 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OSMP13725 252 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 MAOAP21397 527 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DRD5P21918 477 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 LCN1P31025 176 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GABRA3P34903 492 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2G5P39877 138 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR1D4P47884 311 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GSSP48637 474 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CRISP1P54107 249 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CDH15P55291 814 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CSNK2BP67870 215 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC35A2P78381 396 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HPCAP84074 193 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ST3GAL3Q11203 375 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TRAM2Q15035 370 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DECR1Q16698 335 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 MEP1AQ16819 746 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DEF8Q6ZN54 512 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 MRGPREQ86SM8 312 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SATL1Q86VE3 508 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CMIPQ8IY22 773 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 EID2Q8N6I1 236 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR52J3Q8NH60 311 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.56□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms