RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 CHRNB1P11230 501 aa16.97■□□□□ 0.31
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SPNS3-201ENST00000355530 RAB25P57735 213 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
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SPNS3-201ENST00000355530 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
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SPNS3-201ENST00000355530 TIMP4Q99727 224 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.96■□□□□ 0.31
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SPNS3-201ENST00000355530 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
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SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.95■□□□□ 0.3
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SPNS3-201ENST00000355530 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.95■□□□□ 0.3
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SPNS3-201ENST00000355530 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 LCN9Q8WX39 176 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SERINC2Q96SA4 455 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 TBX5Q99593 518 aa16.94■□□□□ 0.3
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