RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 KCT2Q8NC54 265 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR1S1Q8NH92 325 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ASB12Q8WXK4 309 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TOX2Q96NM4 488 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 WDR26Q9H7D7 661 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 KLHL1Q9NR64 748 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 HIDE1A8MVS5 230 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LEFTY1O75610 366 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 UBL3O95164 117 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SIX6O95475 246 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 CLTBP09497 229 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 UQCRC2P22695 453 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 NTHL1P78549 312 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 DEFA5Q01523 94 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ARSIQ5FYB1 569 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LILRA6Q6PI73 481 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 CMIPQ8IY22 773 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MORN4Q8NDC4 146 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 FANK1Q8TC84 345 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 AUNIPQ9H7T9 357 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 RP2O75695 350 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ADRB1P08588 477 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ACP5P13686 325 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MMP15P51511 669 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ASPGQ86U10 573 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LRRC46Q96FV0 321 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR10A4Q9H209 315 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 A0A0B4J203 849 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR6C65A6NJZ3 312 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MID1O15344 667 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC16A5O15375 505 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SUSD5O60279 629 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TGM6O95932 706 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TGFB1P01137 390 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PPM1AP35813 382 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PREPP48147 710 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 EMC3Q9P0I2 261 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.69■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 A0A0G2JK05 382 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LRRN3E7EW58 273 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 IGHA1P01876 353 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 IL3P08700 152 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 GALP22466 123 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ARHGDIBP52566 201 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 RFKQ969G6 155 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 CA5BQ9Y2D0 317 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 NOTCH4Q99466 2003 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 D6RAR5 112 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 PRSS44E7EML9 344 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 F8W036 122 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ARPC5O15511 151 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SIGLEC6O43699 453 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SDC3O75056 442 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 KLHL18O94889 574 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ADH1AP07327 375 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 S100A12P80511 92 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SHC2P98077 582 aa15.68■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms