RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 KLF4O43474 513 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ENTPD6O75354 484 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CER1O95813 267 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 DDAH2O95865 285 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PTNP21246 168 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 STAT5AP42229 794 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC37A1P57057 533 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 FGFBP1Q14512 234 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 STX19Q8N4C7 294 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 IFI44Q8TCB0 444 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ARSGQ96EG1 525 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TECTAO75443 2155 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 RP1P56715 2156 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 STSP08842 583 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PSMB9P28065 219 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 GIPRP48546 466 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PCYT1AP49585 367 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SMSP52788 366 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 RNF217Q8TC41 542 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF721Q8TF20 911 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 Q96MT0 163 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 OR6C1Q96RD1 312 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 LMF1Q96S06 567 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT9Q9BW91 350 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC22A11Q9NSA0 550 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CTSFQ9UBX1 484 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ARHGAP33O14559 1287 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PRKYO43930 277 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV3-11P04433 115 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 LCKP06239 509 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ACVR2AP27037 513 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 RORAP35398 523 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PPICP45877 212 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 DAB2P98082 770 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF613Q6PF04 617 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM239Q8WW34 195 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 FCGR1BQ92637 280 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 YIPF6Q96EC8 236 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 RARRES3Q9UL19 164 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CFL2Q9Y281 166 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PI4KAP42356 2102 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 TIAF1O95411 115 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CKMT1AP12532 417 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC15A1P46059 708 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ST3GAL4Q11206 333 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 IRF3Q14653 427 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 NSDHLQ15738 373 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 OCLNQ16625 522 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF620Q6ZNG0 422 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF550Q7Z398 422 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 CMIPQ8IY22 773 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-201ENST00000336128 PFN4Q8NHR9 129 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms