RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326715.4

VWDE-202, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 5

Gene VWDE, Length 1,394 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-202ENST00000326715 TMEM185BQ9H7F4 350 aa13.06□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.06□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MKLN1Q9UL63 735 aa13.06□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 EFNA2O43921 213 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ACTL6AO96019 429 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PGRP06401 933 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 COX6B1P14854 86 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CPN1P15169 458 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 BMP5P22003 454 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 UQCRC2P22695 453 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PSPHP78330 225 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PLAURQ03405 335 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 GPR68Q15743 365 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 KLHL26Q53HC5 615 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PDZK1Q5T2W1 519 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 RNF130Q86XS8 419 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 EID3Q8N140 333 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 NATD1Q8N6N6 113 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ZNF614Q8N883 585 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 FIG4Q92562 907 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 C7orf26Q96N11 449 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CCDC115Q96NT0 180 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 OR52E6Q96RD3 313 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SLC35A5Q9BS91 424 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 VIPAS39Q9H9C1 493 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 UBQLN4Q9NRR5 601 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CARD8Q9Y2G2 431 aa13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CCDC154A6NI56 674 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CLDN24A6NM45 220 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 NGFRP08138 427 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 IGFBP2P18065 325 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 C17orf67Q0P5P2 114 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MAPK11Q15759 364 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ANKFN1Q8N957 763 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 RFWD2Q8NHY2 731 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CKAP2Q8WWK9 683 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MED17Q9NVC6 651 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa13.04□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ABCA4P78363 2273 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CD8B2A6NJW9 211 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SCDO00767 359 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 UBDO15205 165 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 HCRTR2O43614 444 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SLC22A3O75751 556 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 PEPDP12955 493 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ATP6V1C1P21283 382 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CHMP24386 653 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MSX1P28360 303 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CLK3P49761 638 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ATP12AP54707 1039 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 AQP5P55064 265 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 SYPL1Q16563 259 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 TIGD2Q4W5G0 525 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ZNF621Q6ZSS3 439 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 GGNQ86UU5 652 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 LACC1Q8IV20 430 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 KIRREL3Q8IZU9 778 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 ZPLD1Q8TCW7 415 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.03□□□□□ -0.32
VWDE-202ENST00000326715 MOAP1Q96BY2 351 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms