RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 LRIT2A6NDA9 550 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 HOXC5Q00444 222 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 NUMA1Q14980 2115 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.46■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 J3KTA2 159 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 NR4A2P43354 598 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ALG10Q5BKT4 473 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 COX20Q5RI15 118 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 LDAHQ9H6V9 325 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 THSD1Q9NS62 852 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CD8B2A6NJW9 211 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CD8BP10966 210 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CD40LGP29965 261 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PBX2P40425 430 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 GIPRP48546 466 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 DAPP51397 102 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TSPAN31Q12999 210 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PDE7AQ13946 482 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PIGUQ9H490 435 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 GLULP15104 373 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 HCKP08631 526 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 RIDAP52758 137 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 OR1Q1Q15612 314 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 RAET1LQ5VY80 246 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SHFQ7M4L6 423 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF283Q8N7M2 679 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ASB15Q8WXK1 588 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 OR52D1Q9H346 318 aa15.45■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TSPAN11A1L157 253 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SYNGR4O95473 234 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 B4GALNT1Q00973 533 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM64Q6YI46 380 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM163Q8TC26 289 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 HAVCR1Q96D42 359 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SIPA1L1O43166 1804 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 P04436 131 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CHMP24386 653 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 KCNJ5P48544 419 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 MAB21L1Q13394 359 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 RFT1Q96AA3 541 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 OR1F2PQ96R84 312 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 DHDHQ9UQ10 334 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TLCD2A6NGC4 264 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 OPRD1P41143 372 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CBFBQ13951 182 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PGGHGQ32M88 737 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SLC6A18Q96N87 628 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ALG8Q9BVK2 526 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 POM121BA6NF01 834 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 LRRTM2O43300 516 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF208O43345 1280 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CER1O95813 267 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 SLC37A2Q8TED4 501 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 ADOQ96SZ5 270 aa15.44■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.43■□□□□ 0.06
ITGA3-202ENST00000320031 CD63P08962 238 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms