RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LYPD3O95274 346 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GP1BAP07359 652 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGF5P12034 268 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCMT1P22061 227 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FPR3P25089 353 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF7P61962 342 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADIPOR1Q96A54 375 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRSS27Q9BQR3 290 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRYLO94915 3013 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLF4O43474 513 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITIH1P19827 911 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OCA2Q04671 838 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGFQ07326 219 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBA3CQ13748 450 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL11RAQ14626 422 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDT9Q9BW91 350 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.18■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3D21A4FU49 640 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC14L2O76054 403 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL33O95760 270 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF614Q8N883 585 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR13F1Q8NGS4 319 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6C76A6NM76 312 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS10O43665 173 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACP1P24666 158 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCN1P31025 176 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK5Q00535 292 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EBPQ15125 230 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF550Q7Z398 422 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRMQ8IXM6 262 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MUL1Q969V5 352 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPP4Q96JB8 637 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM2Q9C040 744 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERINC4A6NH21 518 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC5A2P31639 672 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL26Q53HC5 615 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP12Q6UXS9 341 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OVCH1Q7RTY7 1134 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF18BQ86Y91 864 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMPERQ8N8U9 685 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR4C3Q8NH37 302 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEAL3Q969E4 200 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.16■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0B4J2E0 115 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GX12 115 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLCA1A8K7I4 914 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TO15178 435 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NTN1O95631 604 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADH7P40394 386 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms