RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 NPIPB9F8W1W9 429 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 YKT6O15498 198 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 LYPD3O95274 346 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 LCKP06239 509 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 ACVR2AP27037 513 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa21.02■□□□□ 0.96
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 PRKYO43930 277 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 FMO6PO60774 539 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TIAF1O95411 115 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 NR4A1P22736 598 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 PSMB9P28065 219 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 FOXL2P58012 376 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ST3GAL4Q11206 333 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 NSDHLQ15738 373 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF141Q15928 474 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 OR4C3Q8NH37 302 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A12Q8TD20 617 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 CTSFQ9UBX1 484 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 MKL2Q9ULH7 1088 aa21.02■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 KLF4O43474 513 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 NOL3O60936 208 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 FPR3P25089 353 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ATP12AP54707 1039 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 OCA2Q04671 838 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 LPAL2Q16609 132 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 STX19Q8N4C7 294 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 POGLUT1Q8NBL1 392 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 OR8J1Q8NGP2 316 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 VN1R1Q9GZP7 353 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A11Q9NSA0 550 aa21.01■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPW3 197 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42EP2O14613 210 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 DDAH2O95865 285 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ADRA2AP08913 450 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 PCYT1AP49585 367 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ACY1Q03154 408 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 FGFBP1Q14512 234 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 COX15Q7KZN9 410 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 DTWD2Q8NBA8 298 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 IFI44Q8TCB0 444 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 GRHL3Q8TE85 626 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF721Q8TF20 911 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC74BQ96LY2 380 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A19Q9HC21 320 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM221A6NGB7 291 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 M0R296 226 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV3-11P04433 115 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SMSP52788 366 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 PFN4Q8NHR9 129 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 RAB2BQ8WUD1 216 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 NAT6Q93015 286 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF559Q9BR84 538 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 FLRT3Q9NZU0 649 aa21■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SEC16AO15027 2179 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 DYRK3O43781 588 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM239Q8WW34 195 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM64BA6NI03 449 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 TTC36A6NLP5 189 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP33O14559 1287 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 RORAP35398 523 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 STAT5AP42229 794 aa20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms