RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.294e-6■■■□□ 18.1
RP9-201ENST00000297157 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 OR5M10Q6IEU7 315 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 BHLHB9Q6PI77 547 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 MARCH3Q86UD3 253 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 COX18Q8N8Q8 333 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 CDS1Q92903 461 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 DOCK7Q96N67 2140 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 G6PC3Q9BUM1 346 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 SDHAF3Q9NRP4 125 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 EDARQ9UNE0 448 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 MPDZO75970 2070 aa23.1■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 A0A1W2PQD3 144 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 NPIPB9F8W1W9 429 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 CFLARO15519 480 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 SCO2O43819 266 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 GSTA3Q16772 222 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 FIGNL1Q6PIW4 674 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 C6orf120Q7Z4R8 191 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 VPS37AQ8NEZ2 397 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 OR5AK3PQ8NH89 298 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 DTNBP1Q96EV8 351 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 UBQLN4Q9NRR5 601 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 TAS2R10Q9NYW0 307 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 JKAMPQ9P055 326 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ANGPTL1O95841 491 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 PGRP06401 933 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 UQCRC2P22695 453 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 CHMP24386 653 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 S100A3P33764 101 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 SORDQ00796 357 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 C17orf67Q0P5P2 114 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 GANABQ14697 944 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 TMEM44Q2T9K0 475 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 SPDYE7PQ495Y7 208 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 CCNJQ5T5M9 372 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 SAXO2Q658L1 398 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ANKRD46Q86W74 232 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ADAMTS15Q8TE58 950 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 DUSP19Q8WTR2 217 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 STON2Q8WXE9 905 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 OR7D2Q96RA2 312 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 DSN1Q9H410 356 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ZIM2Q9NZV7 527 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 CAMK2AQ9UQM7 478 aa23.08■■□□□ 1.29
RP9-201ENST00000297157 ABCA2Q9BZC7 2435 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 GUSBP08236 651 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 DPP4P27487 766 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 RFX3P48380 749 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 CLK3P49761 638 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 DGKQP52824 942 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 LRRC74AQ0VAA2 488 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 GALNT10Q86SR1 603 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 OR4A15Q8NGL6 344 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 JADE3Q92613 823 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 NEURL3Q96EH8 262 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 CALHM2Q9HA72 323 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 HHATLQ9HCP6 504 aa23.07■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 TUBAL3A6NHL2 446 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 IL18BPO95998 194 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 EPXP11678 715 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 CTSSP25774 331 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 LHX2P50458 406 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 NME5P56597 212 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 TOMM20Q15388 145 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 KLHL26Q53HC5 615 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 DCST2Q5T1A1 773 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 IFNEQ86WN2 208 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 KIF18BQ86Y91 864 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 CLEC4FQ8N1N0 589 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 OR4K17Q8NGC6 315 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 OR14L1PQ8NHC6 308 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 ZPLD1Q8TCW7 415 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 MAGEB18Q96M61 343 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 UCN2Q96RP3 112 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 SDF2Q99470 211 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 MED11Q9P086 117 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.06■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 DUXAA6NLW8 204 aa23.05■■□□□ 1.28
RP9-201ENST00000297157 C9JVG2 144 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms