RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TSC22D1Q15714 1073 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PFKFB4Q16877 469 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MSS51Q4VC12 460 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR31Q5SQ13 230 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ISCA2Q86U28 154 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM110BQ8TC76 370 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS4Q96RK4 519 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR22Q99680 433 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR14Q9BWN1 585 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BRF2Q9HAW0 419 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCO1Q9UM00 188 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX6Q9UNH7 406 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DYSFO75923 2080 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM89A2RUT3 159 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 VWC2LB2RUY7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GMFGO60234 142 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PTNP21246 168 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PAX7P23759 505 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CD40P25942 277 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A1P30825 629 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR3A2P47893 321 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PHC1P78364 1004 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFA6Q01524 100 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MLC1Q15049 377 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LTB4RQ15722 352 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GRTP1Q5TC63 336 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH3Q86UD3 253 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRA2Q8N149 483 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD3Q8WU67 409 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 NXNL1Q96CM4 212 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRG7Q96K78 797 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF145Q96MT1 663 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HBEGFQ99075 208 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RBBP8Q99708 897 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC3Q9P0I2 261 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ANK2Q01484 3957 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WV62 115 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0J9YW62 118 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRB8 838 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BNH8 94 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R1B8 84 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 SCDO00767 359 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS14O43566 566 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PGM3O95394 542 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 UTS2O95399 124 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA4LO95757 839 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD3B1P14060 373 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD3B2P26439 372 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-201ENST00000296642 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms