RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 UPB1Q9UBR1 384 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 KNTC1P50748 2209 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PPM1DO15297 605 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C1QBP02746 253 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 XCR1P46094 333 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR2L5Q8NG80 312 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SMPDL3BQ92485 455 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 EID2BQ96D98 161 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C1orf105O95561 183 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TACSTD2P09758 323 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LAG3P18627 525 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CR2P20023 1033 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 GDNFP39905 211 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR2L3Q8NG85 312 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PTPRFP10586 1907 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 BMP1P13497 986 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 VIPR2P41587 438 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TAS2R43P59537 309 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LTB4RQ15722 352 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 AFMIDQ63HM1 303 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR56A3Q8NH54 315 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FIBINQ8TAL6 211 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CDS1Q92903 461 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 H3BUI4 141 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 AKR1C4P17516 323 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ASAH1Q13510 395 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TMC8Q8IU68 726 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PRRC1Q96M27 445 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 A0A0A6YYJ9 748 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LDB3O75112 727 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ARHGEF15O94989 841 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 HBQ1P09105 142 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ERVFC1P60507 584 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 GALK2Q01415 458 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PGGHGQ32M88 737 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CCDC107Q8WV48 283 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FATE1Q969F0 183 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NIPAL2Q9H841 368 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PDFQ9HBH1 243 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 H0YIV9 168 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 H7C0S8 307 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC43A1O75387 559 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SOD2P04179 222 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 AMY2AP04746 511 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NPPBP16860 134 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CCKBRP32239 447 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PPM1AP35813 382 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR3A2P47893 321 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 DGCR2P98153 550 aa14.73□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms