RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 ARL4AP40617 200 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CRYBA2P53672 197 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CAV3P56539 151 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TAP2Q03519 686 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ACSM1Q08AH1 577 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 BIKQ13323 160 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NAE1Q13564 534 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGEF7Q14155 803 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 DOC2AQ14183 400 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR8G1Q15617 311 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MPPED2Q15777 294 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MON1AQ86VX9 555 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SIAH3Q8IW03 269 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR56A3Q8NH54 315 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF382Q96SR6 550 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM100Q9NV29 134 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RLIMQ9NVW2 624 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PCTPQ9UKL6 214 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TTC3P53804 2025 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TSTD3H0UI37 97 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ITGB1BP1O14713 200 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ARPC5O15511 151 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 C1SP09871 688 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4E1P0C645 316 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CYBAP13498 195 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 S1PR1P21453 382 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ADRA1AP35348 466 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TM4SF4P48230 202 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CCR9P51686 369 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PRR5P85299 388 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 POU4F2Q12837 409 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MADCAM1Q13477 382 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF345Q14585 488 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MELKQ14680 651 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SURF1Q15526 300 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NETO2Q8NC67 525 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 BBS10Q8TAM1 723 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 FGF11Q92914 225 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM72A0PK05 275 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 A8MWP6 167 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 A8MXE2 369 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 EMC8O43402 210 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SUV39H1O43463 412 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF682O95780 498 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 AK1P00568 194 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 CD79AP11912 226 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 NQO2P16083 231 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 VIPR1P32241 457 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 GNALP38405 381 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 WNT3P56703 355 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 WNT4P56705 351 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC26A5P58743 744 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 BLOC1S1P78537 153 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 SGCGQ13326 291 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF2E1-201ENST00000283875 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms