RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ACRV1P26436 265 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GKP32189 559 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OPRL1P41146 370 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 HLCSP50747 726 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CLCQ05315 142 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 RNF151Q2KHN1 245 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PDZD3Q86UT5 571 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 RNF175Q8N4F7 328 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 REEP4Q9H6H4 257 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MYO7AQ13402 2215 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 FAM72CH0Y354 149 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 M0QZ24 198 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NME6O75414 186 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GADD45GO95257 159 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 HMGN1P05114 100 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SP9P0CG40 484 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PGAM2P15259 253 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CHRNEQ04844 493 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SCAPQ12770 1279 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GXYLT1Q4G148 440 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 IFI44LQ53G44 452 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 FAM72BQ86X60 149 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR56A3Q8NH54 315 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ARL11Q969Q4 196 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SPTSSAQ969W0 71 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GDF15Q99988 308 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 EVPLQ92817 2033 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SULT2B1O00204 365 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CCL22O00626 93 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NPHS1O60500 1241 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ALOX12BO75342 701 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SLC43A1O75387 559 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SNAPINO95295 136 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PET100P0DJ07 73 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CHRNA4P43681 627 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR3A3P47888 321 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR3A2P47893 321 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NUDT6P53370 316 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MTPNP58546 118 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SIRPAP78324 504 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SHC2P98077 582 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 STK35Q8TDR2 534 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 DAPL1A0PJW8 107 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 EMC8O43402 210 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SCGB1D2O95969 90 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PKLRP30613 574 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GABRA3P34903 492 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GLP1RP43220 463 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 LIPJQ5W064 366 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CORO6Q6QEF8 472 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 BEST4Q8NFU0 473 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR13H1Q8NG92 308 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GATA6Q92908 595 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SCAMP4Q969E2 229 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 RDH12Q96NR8 316 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PEBP4Q96S96 227 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms