RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ALX3O95076 343 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SOAT1P35610 550 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A3P48764 834 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD11B2P80365 405 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZK1Q5T2W1 519 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DDI2Q5TDH0 399 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM131AQ6UXB0 335 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 NOXA1Q86UR1 476 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SGPP1Q9BX95 441 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FFAR1O14842 300 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB36O95755 333 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 H1F0P07305 194 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R50P59544 299 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB110Q30KQ9 67 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 GPAT3Q53EU6 434 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL22Q53GT1 634 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGD3Q6B0B8 471 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 D2HGDHQ8N465 521 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM246Q9BRR3 403 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TSSK6Q9BXA6 273 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 AHSPQ9NZD4 102 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TAC3Q9UHF0 121 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSL6Q9UKU0 697 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAD8Q9UKU7 415 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0J9YY10 115 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TIAF1O95411 115 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 MC2RQ01718 297 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP7Q16829 419 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2L3Q8NG85 312 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SMPDL3AQ92484 453 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMD6Q96NE9 622 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MIEF1Q9NQG6 463 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 USP24Q9UPU5 2620 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP12A6NFH5 140 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BGRLO75368 114 aa24.46■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 CASP9P55211 416 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TBPL1P62380 186 aa24.46■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5P2Q8WZ92 322 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF170Q96K19 258 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRL4Q96PJ5 515 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 GON7Q9BXV9 100 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 SNTNA6NMZ2 147 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 B4E171 279 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10H3O60404 316 aa24.45■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN7P41732 249 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL4DP49703 201 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AK3PQ8NH89 298 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD7Q96MP8 289 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF607Q96SK3 696 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF121Q9H920 327 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A20Q9NP91 592 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF21Q9NSA1 209 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa24.45■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 H3BN98 237 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP7B1O75881 506 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CDRT1O95170 752 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF28P17035 718 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL9P24844 172 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MC1RQ01726 317 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP27C1Q4G0S4 372 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX5LQ8IYB4 626 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TCTE3Q8IZS6 198 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNPO2LQ9H987 977 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROD4Q9HD90 331 aa24.45■■□□□ 1.5
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