RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF30P17039 623 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MELKQ14680 651 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 AANATQ16613 207 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM65Q6PI78 240 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NUDT13Q86X67 352 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IRF7Q92985 503 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ENTPD4Q9Y227 616 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 H0YC42 278 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NDUFS4O43181 175 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PCDH8O95206 1070 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 APOC3P02656 99 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ADRB1P08588 477 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LCN1P31025 176 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PFN4Q8NHR9 129 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CREB3L1Q96BA8 519 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LINC00052Q96N35 136 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.64■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1B0GVT2 93 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 EFCAB14O75071 495 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IFNA7P01567 189 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PRKACAP17612 351 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 AHCYP23526 432 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A1P30531 599 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CTNNB1P35222 781 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SOX2P48431 317 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PRLHRP49683 370 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CDK5Q00535 292 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 C11orf88Q6PI97 169 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SHISA5Q8N114 240 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LYSMD1Q96S90 227 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MICU1Q9BPX6 476 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PRQ8 180 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM129A0AVI4 362 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GMDSO60547 372 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LGI1O95970 557 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CERS1P27544 350 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MAPK9P45984 424 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 HSF2Q03933 536 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PDE7AQ13946 482 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FAM46CQ5VWP2 391 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RTL4Q6ZR62 310 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MORN4Q8NDC4 146 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 DERL3Q96Q80 235 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PPL8 197 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 VIPR2P41587 438 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRAM2Q15035 370 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 Q6ZTK2 550 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR2T4Q8NH00 348 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PRRC1Q96M27 445 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR1A2Q9Y585 309 aa15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GPR171O14626 319 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IFNGR2P38484 337 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GRM7Q14831 915 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 Q6ZNB5 142 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR2T33Q8NG76 320 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms