RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641321.1

CASC19-222, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,173 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-222	ENST00000641321	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PDHA2	P29803	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MIP	P30301	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PKLR	P30613	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PRKCI	P41743	596 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FNTA	P49354	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF136	P52737	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NR1H2	P55055	460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	B2M	P61769	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RIPK1	Q13546	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FAM53B	Q14153	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TRADD	Q15628	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ABHD13	Q7L211	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	DPP10	Q8N608	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MCU	Q8NE86	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	OR2M7	Q8NG81	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	COPS8	Q99627	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NRTN	Q99748	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321		B9A039	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321		E7EVH7	732 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321		F8W8V4	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	APOL1	O14791	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PGRMC2	O15173	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RGS10	O43665	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MFSD11	O43934	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CIDEA	O60543	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	LMX1B	O60663	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CTSV	O60911	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NR2F1	P10589	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	UCHL3	P15374	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PRKACB	P22694	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CRYGS	P22914	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PEX2	P28328	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	EPHA3	P29320	983 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PCK1	P35558	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MAGEA5	P43359	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PCYT1A	P49585	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	DIO3	P55073	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	DSTN	P60981	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SST	P61278	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	VLDLR	P98155	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	OGDH	Q02218	1023 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CBX3	Q13185	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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