RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 SLC6A5Q9Y345 797 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 C17orf105B2RV13 164 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TSC22D2O75157 780 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 GRK5P34947 590 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PSMB10P40306 273 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TPTEP56180 551 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TDGQ13569 410 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 IL18Q14116 193 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 INAVAQ3KP66 663 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ZNF404Q494X3 552 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SAXO2Q658L1 398 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MFSD9Q8NBP5 474 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FANK1Q8TC84 345 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RASSF5Q8WWW0 418 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TSSK2Q96PF2 358 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MESP1Q9BRJ9 268 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 LRRC61Q9BV99 259 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PDE7BQ9NP56 450 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TMEM9Q9P0T7 183 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PADI2Q9Y2J8 665 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 A0A075B6Q4 140 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 A0A0A6YYD5 115 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ARHGAP33O14559 1287 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SEMA7AO75326 666 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CD79BP40259 229 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MTNR1AP48039 350 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ELOCQ15369 112 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 GFOD2Q3B7J2 385 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 LYPD4Q6UWN0 246 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RTL4Q6ZR62 310 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 USP51Q70EK9 711 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PRSS48Q7RTY5 328 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ANKK1Q8NFD2 765 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ZNF671Q8TAW3 534 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 HCAR2Q8TDS4 363 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SNX33Q8WV41 574 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TMEM80Q96HE8 168 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 C20orf141Q9NUB4 165 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ENPP5Q9UJA9 477 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PI4KAP42356 2102 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 A0A0J9YY10 115 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 HYKKA2RU49 373 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TVP23AA6NH52 213 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SNTNA6NMZ2 147 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FAAHO00519 579 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SLC16A6O15403 523 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PLOD3O60568 738 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 BMP8BP34820 402 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RGS6P49758 472 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TMBIM6P55061 237 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TNFRSF17Q02223 184 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 NAXEQ8NCW5 288 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 APH1BQ8WW43 257 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 C8orf44Q96CB5 159 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 NDC1Q9BTX1 674 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 Q9N2J8 555 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MED31Q9Y3C7 131 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 H3BML4 177 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CCRL2O00421 344 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 GPR75O95800 540 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CDK1P06493 297 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 BMP4P12644 408 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SDC2P34741 201 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FZD2Q14332 565 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ZNF846Q147U1 533 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 KIR2DS3Q14952 304 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 OR1Q1Q15612 314 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TP53I3Q53FA7 332 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TRIM69Q86WT6 500 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms