RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 INSL6Q9Y581 213 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CPED1A4D0V7 1026 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 F8W036 122 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 IL1AP01583 271 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLUP10909 449 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NPR2P20594 1047 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 BLOC1S1P78537 153 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 DHCR24Q15392 516 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 KRBOX4Q5JUW0 171 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM109AQ8N4B1 249 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 MOAP1Q96BY2 351 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 HS6ST2Q96MM7 605 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NEDD4LQ96PU5 975 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR52D1Q9H346 318 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDUFAF4Q9P032 175 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRSS3P35030 304 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PBX2P40425 430 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 BLKP51451 505 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAB40BQ12829 278 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 AQP6Q13520 282 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FCN2Q15485 313 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAM1Q15629 374 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCSMST1Q4G0I0 132 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNX11Q9Y5W9 270 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GABRPO00591 440 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 VEGFDO43915 354 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 H2BFMP0C1H6 154 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADRB3P13945 408 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TUBG1P23258 451 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSNK1DP48730 415 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SGSHP51688 502 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHRNEQ04844 493 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARHGAP40Q5TG30 622 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LCN10Q6JVE6 187 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 C3P1Q6ZMU1 363 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACOT4Q8N9L9 421 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PEX11GQ96HA9 241 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2M4Q96R27 311 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A1W2PPL8 197 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CACNG3O60359 315 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LDB3O75112 727 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SHC1P29353 583 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OCLNQ16625 522 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 DUSP7Q16829 419 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM185AQ8NFB2 350 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM239Q8WW34 195 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CEP250Q9BV73 2442 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTA2P62736 377 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTG2P63267 376 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TAP2Q03519 686 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GALEQ14376 348 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM225Q6GV28 225 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 C16orf58Q96GQ5 468 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 BRF2Q9HAW0 419 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADAM23O75077 832 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 HRGP04196 525 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD300CQ08708 224 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPM6BQ13491 265 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CARD17Q5XLA6 110 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM205Q6UW68 189 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAD9AQ99638 391 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF649Q9BS31 505 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTL8Q9H568 366 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 COPS3Q9UNS2 423 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 EVPLQ92817 2033 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACOD1A6NK06 481 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms