RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559898.5

HDDC3-205, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-205ENST00000559898 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.96■□□□□ 0.15
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HDDC3-205ENST00000559898 SORT1Q99523 831 aa15.94■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.94■□□□□ 0.14
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HDDC3-205ENST00000559898 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.94■□□□□ 0.14
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HDDC3-205ENST00000559898 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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HDDC3-205ENST00000559898 TP53BP2Q13625 1128 aa15.93■□□□□ 0.14
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HDDC3-205ENST00000559898 CPTPQ5TA50 214 aa15.93■□□□□ 0.14
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HDDC3-205ENST00000559898 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.93■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 RNF145Q96MT1 663 aa15.93■□□□□ 0.14
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HDDC3-205ENST00000559898 RNF122Q9H9V4 155 aa15.93■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 MED17Q9NVC6 651 aa15.93■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.93■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15.92■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 SH3D21A4FU49 640 aa15.92■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 TTC36A6NLP5 189 aa15.92■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 TMEM114B3SHH9 223 aa15.92■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HDDC3-205ENST00000559898 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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