RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 SERPINB4P48594 390 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RAC1P63000 192 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HSPB3Q12988 150 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KIAA0040Q15053 153 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GUSBP1Q15486 140 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FAM153CQ494X1 144 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 APOOLQ6UXV4 268 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 BEND4Q6ZU67 534 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 STK32CQ86UX6 486 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HOMEZQ8IX15 550 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CEP112Q8N8E3 955 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CCDC63Q8NA47 563 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NUP43Q8NFH3 380 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OR10D3Q8NH80 312 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NUDT8Q8WV74 236 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PIK3R3Q92569 461 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SLC9A6Q92581 669 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OSTF1Q92882 214 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PPCDCQ96CD2 204 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ARSGQ96EG1 525 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 Q96MF0 132 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GLRX2Q9NS18 164 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OXSMQ9NWU1 459 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 EMCNQ9ULC0 261 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 VDAC3Q9Y277 283 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.32□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 DOCK7Q96N67 2140 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PRB8 838 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 COPEO14579 308 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 AKAP10O43572 662 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CXCL13O43927 109 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PLIN3O60664 434 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HSPA4LO95757 839 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 IGKV1D-16P01601 117 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OPN1LWP04000 364 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PROCP04070 461 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NGFRP08138 427 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ALOX5P09917 674 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF17P17021 662 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PRPH2P23942 346 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CRHR1P34998 444 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MAP3K8P41279 467 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SLC6A8P48029 635 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NR1H2P55055 460 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CARD18P57730 90 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 BEX5Q5H9J7 111 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HBMQ6B0K9 141 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SZRD1Q7Z422 152 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GALNT10Q86SR1 603 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GGNQ86UU5 652 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MISPQ8IVT2 679 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KIF18AQ8NI77 898 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FAM110BQ8TC76 370 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MZB1Q8WU39 189 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PERPQ96FX8 193 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MARK4Q96L34 752 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CCT7Q99832 543 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 REEP4Q9H6H4 257 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TIGARQ9NQ88 270 aa7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MED17Q9NVC6 651 aa7.31□□□□□ -1.24
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