RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ANKRD46	Q86W74	232 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CCDC115	Q96NT0	180 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR52E6	Q96RD3	313 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PRODH2	Q9UF12	536 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CFL2	Q9Y281	166 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CFLAR	O15519	480 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	EMC8	O43402	210 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SUSD5	O60279	629 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	COQ9	O75208	318 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	AGK	Q53H12	422 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PIGG	Q5H8A4	983 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TMEM64	Q6YI46	380 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	LUZP2	Q86TE4	346 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TP53INP1	Q96A56	240 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	VPS33A	Q96AX1	596 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	VSTM2L	Q96N03	204 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SERHL	Q9NQF3	203 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SAR1A	Q9NR31	198 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	MRGBP	Q9NV56	204 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.54	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SH3D21	A4FU49	640 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	DRD5	P21918	477 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PPIC	P45877	212 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PRR5	P85299	388 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TNK1	Q13470	666 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	DCST1	Q5T197	706 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GK5	Q6ZS86	529 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SLC15A4	Q8N697	577 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NUP43	Q8NFH3	380 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SFXN5	Q8TD22	340 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GIMAP5	Q96F15	307 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	BTBD9	Q96Q07	612 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CCL19	Q99731	98 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ITPA	Q9BY32	194 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PROK2	Q9HC23	129 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GALNT8	Q9NY28	637 aa		12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CCDC154	A6NI56	674 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HAX1	O00165	279 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NR5A2	O00482	541 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	EPPIN	O95925	133 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FAM107A	O95990	144 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CT45A8	P0DMV1	189 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CT45A9	P0DMV2	189 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GABRA1	P14867	456 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PEX19	P40855	299 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MAP3K8	P41279	467 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PRKAG1	P54619	331 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RTL4	Q6ZR62	310 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GTF2H4	Q92759	462 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MOAP1	Q96BY2	351 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SPDL1	Q96EA4	605 aa		12.52	□□□□□ -0.41

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