RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	C1orf50	Q9BV19	199 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	NDUFB5	O43674	189 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZNF17	P17021	662 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	DGKQ	P52824	942 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SRY	Q05066	204 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	COX18	Q8N8Q8	333 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	FAM222B	Q8WU58	562 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	DUSP26	Q9BV47	211 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PIGM	Q9H3S5	423 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SCN2B	O60939	215 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CTAG2	O75638	210 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TNFSF13	O75888	250 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GOSR1	O95249	250 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C6orf47	O95873	294 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TGM6	O95932	706 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GUSB	P08236	651 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	UQCRC1	P31930	480 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RFX3	P48380	749 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	HBA1	P69905	142 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	BST1	Q10588	318 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	FOXF2	Q12947	444 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	STX5	Q13190	355 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MYBPH	Q13203	477 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	STX3	Q13277	289 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TESK1	Q15569	626 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KLHL26	Q53HC5	615 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TESC	Q96BS2	214 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	STOML1	Q9UBI4	398 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137		A8MXE2	369 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	EPX	P11678	715 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	BGN	P21810	368 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TP53BP2	Q13625	1128 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CDS1	Q92903	461 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CENPH	Q9H3R5	247 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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