RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PGAM1P18669 254 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN8P19075 237 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PMCHP20382 165 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LMO1P25800 156 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CD1CP29017 333 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TACR3P29371 465 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 KDELR2P33947 212 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MPLP40238 635 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ALDH3B2P48448 385 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS6P49758 472 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GNG10P50151 68 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTBP60709 375 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTA2P62736 377 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTG1P63261 375 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTG2P63267 376 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTC1P68032 377 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTA1P68133 377 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 E2F1Q01094 437 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CFHR3Q02985 330 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MADCAM1Q13477 382 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GAB1Q13480 694 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NAB1Q13506 487 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SPHARQ15513 63 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 EFNB3Q15768 340 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CHI3L2Q15782 390 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CSRP2Q16527 193 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACCSLQ4AC99 568 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MARCH8Q5T0T0 291 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TREML2Q5T2D2 321 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SUSD4Q5VX71 490 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LIPJQ5W064 366 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DHRS13Q6UX07 377 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MOB2Q70IA6 237 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF534Q76KX8 674 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MON1BQ7L1V2 547 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 COMMD2Q86X83 199 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GID4Q8IVV7 300 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NUBPLQ8TB37 319 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HSD17B8Q92506 261 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NUS1Q96E22 293 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF170Q96K19 258 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CXorf58Q96LI9 332 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SERPINB11Q96P15 392 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5B2Q96R09 309 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PRR25Q96S07 402 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 BTBD10Q9BSF8 475 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DUSP16Q9BY84 665 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC22A4Q9H015 551 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GBA3Q9H227 469 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HSFX1Q9UBD0 423 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 KIF25Q9UIL4 384 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NUP50Q9UKX7 468 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 EMCNQ9ULC0 261 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SCML1Q9UN30 329 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 YIPF1Q9Y548 306 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SAR1BQ9Y6B6 198 aa3.22□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms