RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545223.1

PRKAB1-208, Transcript of protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1, human

TSL 2

Gene PRKAB1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAB1-208	ENST00000545223	ZNF614	Q8N883	585 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	SMYD1	Q8NB12	490 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIPK4	Q8NE63	616 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	FIG4	Q92562	907 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ZNF524	Q96C55	264 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	NTNG2	Q96CW9	530 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PRR14	Q9BWN1	585 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	RLIM	Q9NVW2	624 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	LIPT1	Q9Y234	373 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	FBN2	P35556	2912 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223		A0A0G2JPF8	293 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	AGAP5	A6NIR3	686 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	C5orf58	C9J3I9	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CXCR6	O00574	342 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	GNB5	O14775	395 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	GSTA4	O15217	222 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	FRS3	O43559	492 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	KIAA0513	O60268	411 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ADAM11	O75078	769 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	SLC25A12	O75746	678 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ANGPTL1	O95841	491 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	AK1	P00568	194 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HSD17B1	P14061	328 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	GGT1	P19440	569 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	TNFRSF1B	P20333	461 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ATP6V1B2	P21281	511 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	TBXA2R	P21731	343 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ME2	P23368	584 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	HTR1E	P28566	365 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	KDELR2	P33947	212 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	EVI2B	P34910	448 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PCGF2	P35227	344 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	RFC3	P40938	356 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	MAGEA8	P43361	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ERF	P50548	548 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PMP22	Q01453	160 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	RBBP4	Q09028	425 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	VEZF1	Q14119	521 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	EFR3A	Q14156	821 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ZNF141	Q15928	474 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	FXN	Q16595	210 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	DUSP7	Q16829	419 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	KLHL26	Q53HC5	615 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ZNF766	Q5HY98	468 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CBLN3	Q6UW01	205 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223		Q6ZS92	163 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CCDC80	Q76M96	950 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	BBS10	Q8TAM1	723 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	RNF138	Q8WVD3	245 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	TAMM41	Q96BW9	452 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	TMCO6	Q96DC7	493 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	SCMH1	Q96GD3	660 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	NPAS1	Q99742	590 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	RNF32	Q9H0A6	362 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKAB1-208	ENST00000545223	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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