RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 DPH7Q9BTV6 452 aa13.27□□□□□ -0.28
PRAME-214ENST00000543184 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
PRAME-214ENST00000543184 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
PRAME-214ENST00000543184 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
PRAME-214ENST00000543184 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.27□□□□□ -0.28
PRAME-214ENST00000543184 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 WASH3PC4AMC7 463 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 FCMRO60667 390 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 LILRB5O75023 590 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CFDP00746 253 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ACADMP11310 421 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 GIFP27352 417 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ACVR1BP36896 505 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 GPR1P46091 355 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 DCDC1P59894 354 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 NTRK2Q16620 822 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 KLHL12Q53G59 568 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PLBD1Q6P4A8 553 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 LYPD4Q6UWN0 246 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ORAI1Q96D31 301 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 LIPT1Q9Y234 373 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 COL4A3Q01955 1670 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 QSOX1O00391 747 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CDC42EP2O14613 210 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MBTPS2O43462 519 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 RFPL3O75679 317 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 SLC22A5O76082 557 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 HLA-DPB1P04440 258 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PKLRP30613 574 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 WASP42768 502 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 E2F1Q01094 437 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ZSWIM7Q19AV6 140 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 TEX261Q6UWH6 196 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 YAF2Q8IY57 180 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CPXM2Q8N436 756 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 OR4D9Q8NGE8 314 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 HMGB4Q8WW32 186 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 SAMD8Q96LT4 415 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 HYLS1Q96M11 299 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 C12orf66Q96MD2 445 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MS4A8Q9BY19 250 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 AICDAQ9GZX7 198 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PRELID1Q9Y255 219 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 U3KQ87 197 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 C4orf51C9J302 202 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 THY1P04216 161 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 SLC6A1P30531 599 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PLA1AQ53H76 456 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ZNF311Q5JNZ3 666 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 RNLSQ5VYX0 342 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ZNF793Q6ZN11 406 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 SHISA5Q8N114 240 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 KLHL36Q8N4N3 616 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 RFT1Q96AA3 541 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 WDR34Q96EX3 536 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 IL36AQ9UHA7 158 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PLXNA2O75051 1894 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MT-ND4P03905 459 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PDGFAP04085 211 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CLUP10909 449 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 KELP23276 732 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ZNF81P51508 661 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 HCCSP53701 268 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 SMIM11AP58511 58 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 COX10Q12887 443 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MPP7Q5T2T1 576 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 C17orf64Q86WR6 236 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 OR8K5Q8NH50 307 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PRRC1Q96M27 445 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 BBS4Q96RK4 519 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 KCNN3Q9UGI6 736 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 CBLCQ9ULV8 474 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PI15O43692 258 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MPC2O95563 127 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 GYPBP06028 91 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 PPP2R1BP30154 601 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MMP12P39900 470 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 LTB4RQ15722 352 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 C18orf63Q68DL7 685 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-214ENST00000543184 MZT2AQ6P582 158 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms