RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GYG2	O15488	501 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFB5	O43674	189 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PEX1	O43933	1283 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ICOSLG	O75144	302 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PGM3	O95394	542 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	UQCRB	P14927	111 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	IL7R	P16871	459 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PCGF2	P35227	344 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GCK	P35557	465 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ADH7	P40394	386 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CPA2	P48052	419 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC7A2	P52569	658 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CASP9	P55211	416 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GPR68	Q15743	365 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF141	Q15928	474 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	VMAC	Q2NL98	169 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	LIN52	Q52LA3	116 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	EIPR1	Q53HC9	387 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC6A19	Q695T7	634 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM19	Q96HH6	336 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ALG2	Q9H553	416 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL1	Q9NR64	748 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GSTA4	O15217	222 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FADS1	O60427	444 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	UBOX5	O94941	541 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CCL3	P10147	92 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CD1E	P15812	388 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FOXK1	P85037	733 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	BNIP1	Q12981	228 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SYPL1	Q16563	259 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CBR3	O75828	277 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ANGPTL1	O95841	491 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	F10	P00742	488 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	HSD17B1	P14061	328 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NID1	P14543	1247 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	HTR1E	P28566	365 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CHRNE	Q04844	493 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	LIPE	Q05469	1076 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	BNIP2	Q12982	314 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.98	□□□□□ -0.17

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