RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC57Q2TAC2 916 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 LY6G6FQ5SQ64 297 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLX4IPQ5VYV7 408 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 THNSL1Q8IYQ7 743 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR7G3Q8NG95 312 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBALD1Q8TB05 177 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIST1H2ACQ93077 130 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 COQ7Q99807 217 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ULBP2Q9BZM5 246 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM206Q9H813 350 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 LHX9Q9NQ69 397 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM114A2Q9NRY5 505 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GDAP2Q9NXN4 497 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCDC2Q9UHG0 476 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP12Q9UNI6 340 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFNGQ9Y644 331 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 FKBP7Q9Y680 259 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAV40A0A0B4J280 105 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHEK1O14757 476 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 BET1O15155 118 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNPP00491 289 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOA4P06727 396 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINF2P08697 491 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 COX7A1P24310 79 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 OTX2P32243 289 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFC2P35250 354 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIR2DS2P43631 304 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGSHP51688 502 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSNK1G2P78368 415 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASHC5Q12768 1159 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF311Q5JNZ3 666 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 OLFM4Q6UX06 510 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACP7Q6ZNF0 438 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCNT2Q8N0V5 402 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 LSMEM1Q8N8F7 131 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00304Q8N9R0 145 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC114Q96M63 670 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAB39LQ9H9S4 337 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NARFQ9UHQ1 456 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDH7Q9ULB5 785 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAB21L2Q9Y586 359 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SDK2Q58EX2 2172 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAT6BQ8WYB5 2073 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NID2Q14112 1375 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 LAD1O00515 517 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 HCN1O60741 890 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHRNA1P02708 482 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPY1RP25929 384 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOMM20Q15388 145 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIGGQ5H8A4 983 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 MPP7Q5T2T1 576 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD11Q693B1 232 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNC5DQ6UXZ4 953 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOOK3Q86VS8 718 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATAD1Q8NBU5 361 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR4A16Q8NH70 328 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL1F10Q8WWZ1 152 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM37Q8WXS4 190 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMARCD2Q92925 531 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB7BQ96AH8 199 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL3Q9Y4R7 772 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BMH7 237 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GFYI3L273 518 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALT5O43286 388 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR10H3O60404 316 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAMP1O60894 148 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNAPINO95295 136 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTDNEP1O95476 244 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC4A1P02730 911 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GIPP09681 153 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 FERP16591 822 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCARP24071 287 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST8SIA6P61647 398 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACNG7P62955 275 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 VLDLRP98155 873 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFCP2Q12800 502 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF154Q13106 437 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 KARSQ15046 597 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKAIN2Q5VXU1 208 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLEC4GQ6UXB4 293 aa1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms