RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 AZIN1O14977 448 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 NDUFB5O43674 189 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 OPN1LWP04000 364 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ACP2P11117 423 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SDC1P18827 310 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 LIPMQ5VYY2 423 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ZAR1Q86SH2 424 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 GATSQ8NAP1 163 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 NUP43Q8NFH3 380 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CLHC1Q8NHS4 586 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 NPAS1Q99742 590 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 NTMQ9P121 344 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 STOML1Q9UBI4 398 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WZY1 265 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 TBX19O60806 448 aa15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 LINC00032P0C843 101 aa15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 FRKP42685 505 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 DUSP5Q16690 384 aa15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 OR10D3Q8NH80 312 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 FAM110BQ8TC76 370 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC18A2Q05940 514 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PDE7AQ13946 482 aa15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 TDRPQ86YL5 185 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CAVIN3Q969G5 261 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 Q96MF0 132 aa15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.16■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 CXCL13O43927 109 aa15.15■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 NEFHP12036 1026 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CTBP2P56545 445 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 RAC1P63000 192 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PCLAFQ15004 111 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PLPPR5Q32ZL2 321 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 GALNTL6Q49A17 601 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CCNJQ5T5M9 372 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CPTPQ5TA50 214 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 KANK2Q63ZY3 851 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
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