RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 KRT6BP04259 564 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 EPB41P11171 864 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 KRT13P13646 458 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 GDF1P27539 372 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 KRT6CP48668 564 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 GSG1Q2KHT4 349 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 COG4Q9H9E3 785 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.892e-7■■■■□ 23.1
PTPRK-215ENST00000498284 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 A8MU10 97 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 A8MX80 341 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 KLLNB2CW77 178 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 NDC80O14777 642 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 TM9SF1O15321 606 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 GPAA1O43292 621 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 PCCBP05166 539 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 SLC35E2P0CK97 266 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 IGFBP5P24593 272 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.897e-7■■□□□ 13.5
PTPRK-215ENST00000498284 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 MAGEA5P43359 124 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 MEOX2P50222 304 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CAMK4Q16566 473 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 MAPK6Q16659 721 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 FHL5Q5TD97 284 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CBLN3Q6UW01 205 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CYS1Q717R9 158 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 B9D1Q9UPM9 204 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 DUX1O43812 170 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 MFN2O95140 757 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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PTPRK-215ENST00000498284 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 ARMCX2Q7L311 632 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-215ENST00000498284 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.24□□□□□ -1.89
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