RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494422.1

BRD9-211, Transcript of bromodomain containing 9, humanhuman

TSL 3

Gene BRD9, Length 449 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9-211ENST00000494422 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.86□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ANGPT4Q9Y264 503 aa5.86□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.86□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.86□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MED13Q9UHV7 2174 aa5.86□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 A0A087WZY1 265 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CCT8L1PA6NM43 557 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FXYD1O00168 92 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 AIM2O14862 343 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PEX1O43933 1283 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FADS1O60427 444 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MAN1A2O60476 641 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ICOSLGO75144 302 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 UGT2B11O75310 529 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GMNNO75496 209 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CBR3O75828 277 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 TFPTP0C1Z6 253 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CYP4B1P13584 511 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ETFAP13804 333 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 UQCRBP14927 111 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PTGER1P34995 402 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 DCTP40126 519 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FBXW4P57775 412 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 KCNJ2P63252 427 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MXRA7P84157 204 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CDK6Q00534 326 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.473e-7■■■■□ 22.6
BRD9-211ENST00000494422 SCARB2Q14108 478 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 NNATQ16517 81 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CYP51A1Q16850 503 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 VMACQ2NL98 169 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GTDC1Q4AE62 458 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 LIN52Q52LA3 116 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 EIPR1Q53HC9 387 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CCDC80Q76M96 950 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SULF2Q8IWU5 870 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR2T12Q8NG77 320 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR2M7Q8NG81 312 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 DOK4Q8TEW6 326 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PIK3R3Q92569 461 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 RNF145Q96MT1 663 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MUC13Q9H3R2 512 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 STOML1Q9UBI4 398 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.85□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SERINC4A6NH21 518 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 AGAP5A6NIR3 686 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SYT5O00445 386 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 FAAHO00519 579 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 EBAG9O00559 213 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SLC28A2O43868 658 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SUSD5O60279 629 aa5.84□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 HCN1O60741 890 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms