RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CDKL1	Q00532	357 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RELA	Q04206	551 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HNF4G	Q14541	408 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZMYND11	Q15326	602 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PLD3	Q8IV08	490 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UBA3	Q8TBC4	463 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	STARD8	Q92502	1023 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LGALS12	Q96DT0	336 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GBA3	Q9H227	469 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	AZI2	Q9H6S1	392 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CHST11	Q9NPF2	352 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF14	Q9UBS8	474 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OTOF	Q9HC10	1997 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	POU2F1	P14859	743 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF12	P17014	697 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UQCRC2	P22695	453 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CD80	P33681	288 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PLP1	P60201	277 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NAA20	P61599	178 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TNNC1	P63316	161 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DR1	Q01658	176 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRAF3	Q13114	568 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MLANA	Q16655	118 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HKDC1	Q2TB90	917 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	AWAT1	Q58HT5	328 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GIPC3	Q8TF64	312 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ACBD6	Q9BR61	282 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HYKK	A2RU49	373 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC30	A6NM36	301 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SYCE1L	A8MT33	242 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARPC2	O15144	300 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OXT	P01178	125 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IGHV4-39	P01824	125 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IGHG1	P01857	330 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PRKCG	P05129	697 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NAGA	P17050	411 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	P2RY1	P47900	373 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	THOP1	P52888	689 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LIMK2	P53671	638 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PROK1	P58294	105 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HERVK_113	P63132	956 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVK-8	P63133	956 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CSNK1G2	P78368	415 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BNIP1	Q12981	228 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SQLE	Q14534	574 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SPA17	Q15506	151 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ACKR1	Q16570	336 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ODF4	Q2M2E3	257 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PARP6	Q2NL67	630 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CEP78	Q5JTW2	689 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CROCCP2	Q86T23	111 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CUZD1	Q86UP6	607 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BBOF1	Q8ND07	529 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXO32	Q969P5	355 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NRBF2	Q96F24	287 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2

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