RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CENPOQ9BU64 300 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 NTMQ9P121 344 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 YKT6O15498 198 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 FCMRO60667 390 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 PTHP01270 115 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 SYPP08247 313 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 TEKQ02763 1124 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CHRNEQ04844 493 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 DUSP5Q16690 384 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CARFQ8N187 725 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF607Q96SK3 696 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 NEK6Q9HC98 313 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 RHCGQ9UBD6 479 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CTNSO60931 367 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 SLC35E2P0CK97 266 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ACP2P11117 423 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 SPIBQ01892 262 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 MICAQ29983 383 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CCNJQ5T5M9 372 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 SPATC1Q76KD6 591 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 NDC1Q9BTX1 674 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRRT4-205ENST00000489835 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 H0YIG0 161 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CLDN4O14493 209 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ITGA2P17301 1181 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PDX1P52945 283 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 UGT2B15P54855 530 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CDH12P55289 794 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DEFA1P59665 94 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DEFA3P59666 94 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 COPZ1P61923 177 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CDC73Q6P1J9 531 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RABEPKQ7Z6M1 372 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF595Q8IYB9 648 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CRELD1Q96HD1 420 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MKLN1Q9UL63 735 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.08■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PLOD3O60568 738 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PDE9AO76083 593 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RGS6P49758 472 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LIMK1P53667 647 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR52R1Q8NGF1 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PIK3R3Q92569 461 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RIT1Q92963 219 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CTHRC1Q96CG8 243 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RLIMQ9NVW2 624 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 A8MVJ9 347 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CCNKO75909 580 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HSMCR30P0CW71 290 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SSTR4P31391 388 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KCNJ5P48544 419 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PGDP52209 483 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FOXL2P58012 376 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ST3GAL4Q11206 333 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DUSP8Q13202 625 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 VWA2Q5GFL6 755 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KMT5CQ86Y97 462 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NAT6Q93015 286 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR6C1Q96RD1 312 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms