RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	APIP	Q96GX9	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	PLPP1	O14494	284 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	LDB3	O75112	727 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SLC22A3	O75751	556 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CBR3	O75828	277 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	BCKDHA	P12694	445 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	TBXA2R	P21731	343 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	PRDX6	P30041	224 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SOX18	P35713	384 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	MAPK12	P53778	367 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	DSCR9	P59020	149 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SNTA1	Q13424	505 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	IFNE	Q86WN2	208 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	TANK	Q92844	425 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	STARD4	Q96DR4	205 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	MARK4	Q96L34	752 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	DPY30	Q9C005	99 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234		A0A0G2JN53	185 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FRG2C	A6NGY1	282 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SH3BGRL	O75368	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ATP5H	O75947	161 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SCEL	O95171	688 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	KLK1	P06870	262 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CD8B	P10966	210 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	G6PD	P11413	515 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SRD5A1	P18405	259 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SDC1	P18827	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HNF1A	P20823	631 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CERS1	P27544	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	GALNS	P34059	522 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	BSG	P35613	385 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HPCAL1	P37235	193 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CASP3	P42574	277 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CLDN8	P56748	225 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	C21orf58	P58505	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SRY	Q05066	204 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FUT7	Q11130	342 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	NRF1	Q16656	503 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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