RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.55□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.55□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.55□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.55□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5T3Q8NGG3 340 aa3.55□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.55□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC1A5Q15758 541 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 CARTPTQ16568 116 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 KLHL22Q53GT1 634 aa3.54□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 NIPAL1Q6NVV3 410 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R42Q7RTR8 314 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.54□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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