RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PDE9A	O76083	593 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	LDLR	P01130	860 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	GSN	P06396	782 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	GABRA1	P14867	456 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CAPN3	P20807	821 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CHM	P24386	653 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ADH7	P40394	386 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MVD	P53602	400 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	HPCA	P84074	193 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	GNA13	Q14344	377 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF141	Q15928	474 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C3AR1	Q16581	482 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	VASN	Q6EMK4	673 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZAR1	Q86SH2	424 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MARCH3	Q86UD3	253 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DPP10	Q8N608	796 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA7A	O75326	666 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TPO	P07202	933 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	BMP2	P12643	396 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	AGA	P20933	346 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DPP4	P27487	766 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM20	Q15388	145 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CD163	Q86VB7	1156 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	IFNE	Q86WN2	208 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DSN1	Q9H410	356 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf72	A4D263	438 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CLIC1	O00299	241 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CCL21	O00585	134 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPT2	O15123	496 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	NPPA	P01160	153 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	LSP1	P33241	339 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	GFRA1	P56159	465 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FUT5	Q11128	374 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	RGN	Q15493	299 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	GXYLT1	Q4G148	440 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.29	□□□□□ -0.28

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