RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442708.5

USP39-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-205ENST00000442708 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 CHRNEQ04844 493 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 MAPRE2Q15555 327 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 GPAT3Q53EU6 434 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 FADS6Q8N9I5 356 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 MAL2Q969L2 176 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 MED11Q9P086 117 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 WDR45Q9Y484 360 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 GTF3C1Q12789 2109 aa14.6□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 A0A1W2PQD3 144 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 UGT2B17O75795 530 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 IGHG3P01860 377 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 GUSBP08236 651 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 NR2F1P10589 423 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 SLC10A1Q14973 349 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ZNF141Q15928 474 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ADRM1Q16186 407 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 COQ5Q5HYK3 327 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 GFRALQ6UXV0 394 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 OR2M3Q8NG83 312 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 LRRC58Q96CX6 371 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 DSN1Q9H410 356 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 POLE3Q9NRF9 147 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 LIPT1Q9Y234 373 aa14.59□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 MED12Q93074 2177 aa14.58□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
USP39-205ENST00000442708 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 A0A1B0GTH9 108 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 J3QKU1 62 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 SCDO00767 359 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 NDUFB5O43674 189 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 GMFGO60234 142 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 CBR3O75828 277 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 BCHEP06276 602 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 PLAURQ03405 335 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 FADDQ13158 208 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 MMEL1Q495T6 779 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 EIPR1Q53HC9 387 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 RABL3Q5HYI8 236 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 TRILQ7L0X0 811 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 TMEM19Q96HH6 336 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 NANOGQ9H9S0 305 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.58□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 ESPL1Q14674 2120 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 A0A1B0GVC2 190 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 CLDN24A6NM45 220 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 ZIC3O60481 467 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 TRAPPC6AO75865 159 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 HPNP05981 417 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 ARAFP10398 606 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 HPGDP15428 266 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 GZMMP51124 257 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 ZNF117Q03924 483 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 CBLN3Q6UW01 205 aa14.57□□□□□ -0.08
USP39-205ENST00000442708 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms