RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF130Q86XS8 419 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 OR14L1PQ8NHC6 308 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPEARQ8WU66 669 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SPDL1Q96EA4 605 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC120Q96HB5 630 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 MRGBPQ9NV56 204 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 MED11Q9P086 117 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 LIPT1Q9Y234 373 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC13O75165 2243 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 FLNCQ14315 2725 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 AHRRA9YTQ3 701 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZG16O60844 167 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ANP32DO95626 131 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 BMP7P18075 431 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 AGAP20933 346 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CHMP24386 653 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ACVR2AP27037 513 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 DCTP40126 519 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SMSP52788 366 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 STX5Q13190 355 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF141Q15928 474 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 AGKQ53H12 422 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 XKRXQ6PP77 449 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB8BQ92930 207 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 DKKL1Q9UK85 242 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A096LPI6 279 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PP18 115 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf51A8MQB3 221 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BNH8 94 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC01387J3KSC0 135 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGN4O00479 90 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 FCMRO60667 390 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QCP02747 245 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CPN1P15169 458 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ARFIP2P53365 341 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 MVDP53602 400 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CASP9P55211 416 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 GFRA1P56159 465 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CGB2Q6NT52 195 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 AAGABQ6PD74 315 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNEQ86WN2 208 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 PMM1Q92871 262 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ROPN1LQ96C74 230 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 GMEB1Q9Y692 573 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 NCKAP5O14513 1909 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A087WZY1 265 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 NR5A2O00482 541 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 HK1P19367 917 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN3P20807 821 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ADH7P40394 386 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL2A1Q16548 175 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR45Q9Y484 360 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CLIC1O00299 241 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0513O60268 411 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPA8P0DM63 369 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms