RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CCL5P13501 91 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 AQP2P41181 271 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MAP2K4P45985 399 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DLX5P56178 289 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HBG1P69891 147 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HBG2P69892 147 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SCLYQ96I15 445 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 APC2O95996 2303 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 IL4RP24394 825 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR5T1Q8NG75 326 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 OR5W2Q8NH69 310 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HAS2Q92819 552 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 TSPAN11A1L157 253 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UBBP0CG47 229 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 CPOXP36551 454 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FXYD4P59646 89 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 SRPXP78539 464 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TSSK4Q6SA08 328 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SVBPQ8N300 66 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PP55 124 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CD79AP11912 226 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OTX2P32243 289 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GGT5P36269 586 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ECI1P42126 302 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.32□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 ZFP82Q8N141 532 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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