RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MS4A4EQ96PG1 132 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 YIPF4Q9BSR8 244 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 LGALS13Q9UHV8 139 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 VDAC3Q9Y277 283 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZNF175Q9Y473 711 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.63■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TLDC2A0PJX2 215 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CTIFO43310 598 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 EMC8O43402 210 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 OIP5O43482 229 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 SPAG7O75391 227 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 KCNH1O95259 989 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 LAMP1P11279 417 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 NID1P14543 1247 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 IL11P20809 199 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 HOXC12P31275 282 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 GPC1P35052 558 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CD79BP40259 229 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 OR2A2Q6IF42 318 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CAMKMTQ7Z624 323 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 AGR3Q8TD06 166 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PGM2Q96G03 612 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PIGQQ9BRB3 760 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.62■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 LINC01387J3KSC0 135 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TBXA2RP21731 343 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 SHC1P29353 583 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 DIO3P55073 304 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PTGR1Q14914 329 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MLC1Q15049 377 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZNF550Q7Z398 422 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 DDIASQ8IXT1 998 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZFP28Q8NHY6 868 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CXorf36Q9H7Y0 433 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MID2Q9UJV3 735 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.61■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 A0A1W2PRB8 838 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 C7orf72A4D263 438 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 EFNA2O43921 213 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 OPN1LWP04000 364 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CD8BP10966 210 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ZNF17P17021 662 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 UGT2B10P36537 528 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 ETV4P43268 484 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 OCRLQ01968 901 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CDS1Q92903 461 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MTERF3Q96E29 417 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 C1orf50Q9BV19 199 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 MED17Q9NVC6 651 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 GPATCH2Q9NW75 528 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.6■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 NDUFB5O43674 189 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 TYROBPO43914 113 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PEX11AO75192 247 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 THBDP07204 575 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 LINGO3P0C6S8 592 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 NPIPA8P0DM63 369 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 CRYGSP22914 178 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 PRIM2P49643 509 aa16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SGO1-208ENST00000437051 KEAP1Q14145 624 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms