RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP78Q5JTW2 689 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACER2Q5QJU3 275 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPINK14Q6IE38 97 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM40Q6P9F5 258 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM205Q6UW68 189 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UEVLDQ8IX04 471 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC5A8Q8N695 610 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCORP1Q8N888 145 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5CQ8TCD5 201 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOK4Q8TEW6 326 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAR1Q8WVX9 515 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR4A3Q92570 626 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXNL1Q96CM4 212 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGED4Q96JG8 741 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1F2PQ96R84 312 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 F2RL3Q96RI0 385 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYTH2Q99418 400 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 POPDC3Q9HBV1 291 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABI3Q9P2A4 366 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPTCQ9UBM4 332 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TINAGQ9UJW2 476 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPDZO75970 2070 aa4.09□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREBBPQ92793 2442 aa4.09□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PQ72 361 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 URADA6NGE7 173 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLOD5A6NK44 160 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM23A6NLE4 172 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM166BA8MTA8 275 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS44E7EML9 344 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFECO14948 347 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KERAO60938 352 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A12O75746 678 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GBAP04062 536 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA16P05015 189 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA6P08185 405 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF24P17028 368 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN8P19075 237 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPORP19235 508 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGER1P34995 402 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHBP35232 272 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 AHRP35869 848 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCTP40126 519 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNMTP50135 292 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIM2P55344 173 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB38P57729 211 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V0D1P61421 351 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 VAMP2P63027 116 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDKL1Q00532 357 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF8Q02556 426 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RELAQ04206 551 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUNX2Q13950 521 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 INAQ16352 499 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEP1AQ16819 746 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GXYLT1Q4G148 440 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLC3Q6P597 504 aa4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms