RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 LANCL2Q9NS86 450 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 A8MUA0 341 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ADORA3P0DMS8 318 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 LIPAP38571 399 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PCYT1AP49585 367 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB10A6NFE3 127 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GABARAPO95166 117 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 BCL10O95999 233 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GNSP15586 552 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CD36P16671 472 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 MLLT10P55197 1068 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 VBP1P61758 197 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GPLD1P80108 840 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CDK5Q00535 292 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TIGD6Q17RP2 521 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 D2HGDHQ8N465 521 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TSLPQ969D9 159 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ITPAQ9BY32 194 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A19Q9HC21 320 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GPR52Q9Y2T5 361 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 C17orf105B2RV13 164 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 M0R082 166 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CT45A8P0DMV1 189 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CT45A9P0DMV2 189 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TGFBR2P37173 567 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SNAPC1Q16533 368 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CT45A2Q5DJT8 189 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf189Q5VU69 101 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GPR135Q8IZ08 494 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF321PQ8N8H1 164 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CDC42EP2O14613 210 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM11O75078 769 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SMSP52788 366 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS58Q8IYP2 241 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PFN4Q8NHR9 129 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GRHL3Q8TE85 626 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 LRR1Q96L50 414 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 Q96MT0 163 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP54Q96N23 3096 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CPED1A4D0V7 1026 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CH25HO95992 272 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 HSMCR30P0CW71 290 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TGFBR1P36897 503 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SLC15A1P46059 708 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 FUT7Q11130 342 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PMS2CLQ68D20 193 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 NDNFQ8TB73 568 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 FCGR1BQ92637 280 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 LMF1Q96S06 567 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 Q9N2J8 555 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 POLE3Q9NRF9 147 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 FUT1P19526 365 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FPR3P25089 353 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 NCS1P62166 190 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM201Q5SNT2 666 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A6Q6NXT4 461 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF615Q8N8J6 731 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PIGKQ92643 395 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 NDC1Q9BTX1 674 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 TSSK6Q9BXA6 273 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 CLPSP04118 112 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF91Q05481 1191 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 IRF3Q14653 427 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SYT14P1Q58G82 188 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 VWA2Q5GFL6 755 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 GUSBP11Q6P575 273 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 POGLUT1Q8NBL1 392 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 OR5M11Q96RB7 305 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 EFNA3P52797 238 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-209ENST00000428120 EMP3P54852 163 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms