RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PQD3 144 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ZIC3O60481 467 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ANP32DO95626 131 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 GP1BBP13224 206 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 HK1P19367 917 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ATP12AP54707 1039 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 NUP107P57740 925 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 GUCY1A3Q02108 690 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 PMPCAQ10713 525 aa16.36■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 CD226Q15762 336 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 AAGABQ6PD74 315 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 XKRXQ6PP77 449 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 RNF130Q86XS8 419 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ZNF527Q8NB42 609 aa16.36■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 PRDM14Q9GZV8 571 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 HHATLQ9HCP6 504 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 GTF3C1Q12789 2109 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 A0A0G2JND7 137 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 AHRRA9YTQ3 701 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 NR5A2O00482 541 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 STX11O75558 287 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 AGAP20933 346 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 PTGER4P35408 488 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ATP4BP51164 291 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 GFRA1P56159 465 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 RAET1LQ5VY80 246 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 MISPQ8IVT2 679 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ZNF614Q8N883 585 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 RND1Q92730 232 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.35■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16.34■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 KRT75O95678 551 aa16.34■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 GLI4P10075 376 aa16.34■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 CHMP24386 653 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 MSX1P28360 303 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 STARP49675 285 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 B3GALT5-AS1P59052 145 aa16.34■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 GPR68Q15743 365 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 GTDC1Q4AE62 458 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 AGKQ53H12 422 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 KLHL26Q53HC5 615 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.34■□□□□ 0.21
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HERC3-205ENST00000426683 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 COL12A1Q99715 3063 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC13O75165 2243 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 H3BNH8 94 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 CPN1P15169 458 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 SRYQ05066 204 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 FUT5Q11128 374 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-205ENST00000426683 ART3Q13508 389 aa16.33■□□□□ 0.2
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