RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL12AP19105 171 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX6P35712 828 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASLGP48023 281 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDGQ13569 410 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBA3EQ6PEY2 450 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR88Q6ZMY6 472 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL14Q8N4G2 192 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB119Q8N690 84 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLE3Q9NRF9 147 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GON4LQ3T8J9 2241 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF4O00268 1085 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COQ9O75208 318 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NME1P15531 152 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRYBB2P43320 205 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPZBP47756 277 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOCQ15369 112 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1Q1Q15612 314 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGGHGQ32M88 737 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZAR1Q86SH2 424 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHC2Q8IXK0 858 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN22Q8N7P3 220 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMM1Q92871 262 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K3Q99759 626 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEURL2Q9BR09 285 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX12Q9BXU0 123 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCN3Q9P1Z3 774 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STUB1Q9UNE7 303 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WWP2O00308 870 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FMO6PO60774 539 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S1PR1P21453 382 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100A5P33763 92 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLAURQ03405 335 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIPKQ5VXJ0 399 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN10Q9HC96 672 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED17Q9NVC6 651 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL20RAQ9UHF4 553 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA14Q9ULX7 337 aa17.36■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM129A0AVI4 362 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXS1O43638 330 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNK2O95069 426 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYPD3O95274 346 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNH1P13489 461 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD27P26842 260 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD38P28907 300 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH11P55287 796 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNT4P56705 351 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSG6Q00889 435 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC13A2Q13183 592 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AADACL4Q5VUY2 407 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EGFL6Q8IUX8 553 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2T33Q8NG76 320 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYKKA2RU49 373 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROS1P07225 676 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGM1P22735 817 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCGRP47871 477 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKCDQ05655 676 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMX1AQ8TE12 382 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM239Q8WW34 195 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFKQ969G6 155 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCTN2Q96GX1 697 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEX11GQ96HA9 241 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAMD8Q96LT4 415 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASPNQ9BXN1 380 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEX16Q9Y5Y5 336 aa17.35■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PR77 199 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPEP16870 476 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFX3P48380 749 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKP1P63208 163 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2G6Q5TZ20 316 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHFQ7M4L6 423 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GKN2Q86XP6 184 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFN4Q8NHR9 129 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIT1Q92963 219 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPH1Q9BZG8 443 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOLH1BQ9HBA9 442 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C20orf141Q9NUB4 165 aa17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THADAQ6YHU6 1953 aa17.33■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC119BA6NIH7 251 aa17.33■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL12A8MUP2 240 aa17.33■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa17.33■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPK1BO75841 260 aa17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms