RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 SOX6P35712 828 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 GZMMP51124 257 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 DAPP51397 102 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MVDP53602 400 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 COX20Q5RI15 118 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 RHBDD2Q6NTF9 364 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 DOK4Q8TEW6 326 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 COL26A1Q96A83 441 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 RUBCNLQ9H714 662 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 GPR75O95800 540 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CPMP14384 443 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ILKQ13418 452 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 DHRS13Q6UX07 377 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MYDGFQ969H8 173 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TBC1D24Q9ULP9 559 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MPIP34949 423 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 GPC1P35052 558 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 DSG2Q14126 1118 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TIGD6Q17RP2 521 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 NXNL2Q5VZ03 156 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TMEM107Q6UX40 140 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 KAT2AQ92830 837 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 KCNN3Q9UGI6 736 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SRPK3Q9UPE1 567 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 B8ZZF3 427 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 PROB1E7EW31 1015 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ERVH48-1M5A8F1 160 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FHP07954 510 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FGF5P12034 268 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 IL7P13232 177 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 GPX2P18283 190 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 PRKACBP22694 351 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 UQCRC2P22695 453 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SOX18P35713 384 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 E2F1Q01094 437 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FAM109AQ8N4B1 249 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 LANCL2Q9NS86 450 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SLITRK5O94991 958 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 NUDT7P0C024 238 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MAOAP21397 527 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP40Q5TG30 622 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 XKRXQ6PP77 449 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 IDO2Q6ZQW0 420 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 COX15Q7KZN9 410 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 RNF130Q86XS8 419 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MARVELD3Q96A59 401 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 KNTC1P50748 2209 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ZNF28P17035 718 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FPR1P21462 350 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MC3RP41968 323 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 EFNA3P52797 238 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 FOXL2P58012 376 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 MC2RQ01718 297 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 IL11RAQ14626 422 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 RGNQ15493 299 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ISXQ2M1V0 245 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 VWA2Q5GFL6 755 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 AHSA2Q719I0 299 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CHST8Q9H2A9 424 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 C12orf10Q9HB07 376 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 CFL2Q9Y281 166 aa22.7■■□□□ 1.23
CTU1-201ENST00000421832 SHOXO15266 292 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU1-201ENST00000421832 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms