RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL15Q96M94 604 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 VDAC3Q9Y277 283 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 AIFM1O95831 613 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 VRK2Q86Y07 508 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TIGD4Q8IY51 512 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR9A4Q8NGU2 314 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ADOQ96SZ5 270 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNG6Q9BXT2 260 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GMEB1Q9Y692 573 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 I3L521 148 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CFL1P23528 166 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MALLQ13021 153 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TUBB3Q13509 450 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TDGQ13569 410 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TREM1Q9NP99 234 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TJP1Q07157 1748 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NRAPQ86VF7 1730 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 H0YGG7 62 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAPC5O75971 98 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 AMY2BP19961 511 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GVC2 190 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GJE1A6NN92 205 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CRABP1P29762 137 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKXP51817 358 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NUMA1Q14980 2115 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01553A4QN01 128 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NDNFQ8TB73 568 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 BTBD2Q9BX70 525 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RDH8Q9NYR8 311 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LHCGRP22888 699 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX3P41225 446 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 VRK3Q8IV63 474 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 AIFM2Q9BRQ8 373 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 THSD1Q9NS62 852 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB40BQ12829 278 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 EFR3AQ14156 821 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ISL2Q96A47 359 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 HES5Q5TA89 166 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MAVSQ7Z434 540 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5W2Q8NH69 310 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10A4Q9H209 315 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52D1Q9H346 318 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 USP22Q9UPT9 525 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM227AF5H4B4 570 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5J2Q8NH18 312 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CBLCQ9ULV8 474 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK1P06493 297 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK10Q15131 360 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF583Q96ND8 569 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMA4Q16363 1823 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 A6NHS1 94 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GNRHRP30968 328 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 FOLR3P41439 243 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CXCR4P61073 352 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 HDAC8Q9BY41 377 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NLKQ9UBE8 527 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SFTPBP07988 381 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms