RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ASGR1P07306 291 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LAMP2P13473 410 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SDC1P18827 310 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DCKP27707 260 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADORA2BP29275 332 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC26A3P40879 764 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CXCL5P42830 114 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPL29P47914 159 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CX3CR1P49238 355 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGS7P49802 495 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TUBP50607 506 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ESRRGP62508 458 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BIKQ13323 160 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF181Q2M3W8 571 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB41Q5JT25 222 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATRAIDQ6UW56 229 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NRARPQ7Z6K4 114 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WDR86Q86TI4 376 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VRK2Q86Y07 508 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GID4Q8IVV7 300 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SKA3Q8IX90 412 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIR3DL3Q8N743 410 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR10G9Q8NGN4 311 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR9A2Q8NGT5 310 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEPT8Q92599 483 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZUFSPQ96AP4 578 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CREB3L1Q96BA8 519 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CPXM1Q96SM3 734 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCT7Q99832 543 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIMM29Q9BSF4 260 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM121Q9BTD3 319 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TM2D1Q9BX74 207 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX12Q9BXU0 123 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGT1Q9H0U3 335 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPY26PQ9H489 355 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AIG1Q9NVV5 245 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLEK2Q9NYT0 353 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPRR3Q9UBC9 169 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP6V1HQ9UI12 483 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF639Q9UID6 485 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KCNK6Q9Y257 313 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DHRS7Q9Y394 339 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLK4Q9Y5K2 254 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C2orf16Q68DN1 1984 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM223A0PJW6 202 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SH3PXD2BA1X283 911 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C19orf71A6NCJ1 209 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H0YIG0 161 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADAMDEC1O15204 470 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BUB1O43683 1085 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DIAPH2O60879 1101 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPAN9O75954 239 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADCY5O95622 1261 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CPNE6O95741 557 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCNE2O96020 404 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TLX1NBP0CAT3 122 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ICAM2P13598 275 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HRES1P13985 223 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GCKP35557 465 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSMB10P40306 273 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCT5P48643 541 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCR9P51686 369 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLK1P53350 603 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HMGCS1Q01581 520 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBPJQ06330 500 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FUT5Q11128 374 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BNIP1Q12981 228 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TPBGQ13641 420 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSG5Q15238 335 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX44Q53QW1 395 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CPTPQ5TA50 214 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C1orf146Q5VVC0 180 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KCTD11Q693B1 232 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADNP2Q6IQ32 1131 aa-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms