RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.1□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PRB8 838 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CPED1A4D0V7 1026 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZAR1LA6NP61 321 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 B4DGG1 531 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS11DO60235 418 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF10O60809 474 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SH3BGRLO75368 114 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CREG1O75629 220 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PIAS2O75928 621 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PRSS23O95084 383 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 DDAH2O95865 285 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SERPINA1P01009 418 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 IFI6P09912 130 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 UQCRBP14927 111 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ITIH1P19827 911 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 MAGP20916 626 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 UQCRC2P22695 453 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SOAT1P35610 550 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SKP1P63208 163 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 HBA1P69905 142 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PLIN5Q00G26 463 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TNFRSF17Q02223 184 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 EPS8Q12929 822 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 MED21Q13503 144 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 GK3PQ14409 553 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RGNQ15493 299 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CEBPEQ15744 281 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 MPEG1Q2M385 716 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SFT2D3Q587I9 215 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SAXO2Q658L1 398 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PTOV1Q86YD1 416 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PLD3Q8IV08 490 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SVOPLQ8N434 492 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR10G6Q8NH81 332 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NEURL3Q96EH8 262 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RDH12Q96NR8 316 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR2A5Q96R48 311 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SERINC2Q96SA4 455 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CD180Q99467 661 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NRTNQ99748 197 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CHID1Q9BWS9 393 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NLNQ9BYT8 704 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 BATF3Q9NR55 127 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF639Q9UID6 485 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.09□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RTTNQ86VV8 2226 aa6.09□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 STAB1Q9NY15 2570 aa6.09□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR6C74A6NCV1 312 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 C4orf51C9J302 202 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 LMO7DNF2Z398 122 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TXNDC9O14530 226 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 YY2O15391 372 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CLOCKO15516 846 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 AQP9O43315 295 aa6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 DUX1O43812 170 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms