RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394725.2

SIAH1-203, Transcript of siah E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIAH1, Length 2,147 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1-203ENST00000394725 CLDN16Q9Y5I7 305 aa26.09■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 SPAG17Q6Q759 2223 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 TLCD2A6NGC4 264 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 RHPN2P1A8MT19 583 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 CLDN25C9JDP6 229 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 APOL3O95236 402 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 RHAGQ02094 409 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 OGFOD3Q6PK18 319 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 IGFN1Q86VF2 1251 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 ATCAYQ86WG3 371 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF595Q8IYB9 648 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 OSTF1Q92882 214 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 SLC38A2Q96QD8 506 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 PDE7BQ9NP56 450 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 PCDH15Q96QU1 1955 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.08■■□□□ 1.77
SIAH1-203ENST00000394725 IGKV1D-16P01601 117 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SOX3P41225 446 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PDZK1Q5T2W1 519 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 USP43Q70EL4 1123 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 OR6C4Q8NGE1 309 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 IL20Q9NYY1 176 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 RNF215Q9Y6U7 377 aa26.08■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 CCRL2O00421 344 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 MAGEB3O15480 346 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SPHARQ15513 63 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SLC36A4Q6YBV0 504 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF620Q6ZNG0 422 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PFN4Q8NHR9 129 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 DGAT2Q96PD7 388 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 CNPPD1Q9BV87 410 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 MND1Q9BWT6 205 aa26.07■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 CLDN4O14493 209 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 LYPD3O95274 346 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 FUT1P19526 365 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PGDP52209 483 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 LIMK1P53667 647 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TUBA1BP68363 451 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF846Q147U1 533 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 C19orf48Q6RUI8 117 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TUBA1AQ71U36 451 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 NANOGP1Q8N7R0 232 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TAPBPLQ9BX59 468 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 CARD8Q9Y2G2 431 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 MAU2Q9Y6X3 613 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 NNATQ16517 81 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ANKK1Q8NFD2 765 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 OR51Q1Q8NH59 317 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SPACA7Q96KW9 195 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 VSTM2LQ96N03 204 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TBC1D17Q9HA65 648 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 HHATLQ9HCP6 504 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 HMG20AQ9NP66 347 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 POLE3Q9NRF9 147 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 C20orf141Q9NUB4 165 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PIAS2O75928 621 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 RAB36O95755 333 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SCG5P05408 212 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 HBQ1P09105 142 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 OR1D5P58170 312 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 MCFD2Q8NI22 146 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 RNFT2Q96EX2 444 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 NELL2Q99435 816 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 DPH1Q9BZG8 443 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 FBXO8Q9NRD0 319 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PRODHO43272 600 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 BMP4P12644 408 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ETV5P41161 510 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ETV1P50549 477 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 GAS1P54826 345 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ITGADQ13349 1161 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 GARNL3Q5VVW2 1013 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 TMEM239Q8WW34 195 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SAMD8Q96LT4 415 aa26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SDK1Q7Z5N4 2213 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 SURF4O15260 269 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 MAKP20794 623 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 NIPAL1Q6NVV3 410 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 NPSR1Q6W5P4 371 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PMM1Q92871 262 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ZDHHC12Q96GR4 267 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 PALMDQ9NP74 551 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 ERVK-19Q9WJR5 959 aa26.04■■□□□ 1.76
SIAH1-203ENST00000394725 CDH10Q9Y6N8 788 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms