RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 IRGMA1A4Y4 181 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CHP2O43745 196 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 IL18Q14116 193 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC32Q14392 662 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CST6Q15828 149 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FGF13Q92913 245 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01553A4QN01 128 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 UBXN7O94888 489 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 KAT7O95251 611 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TPOP07202 933 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN31Q12999 210 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SGCGQ13326 291 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FGFBP1Q14512 234 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TCEA2Q15560 299 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 VITQ6UXI7 678 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR2L5Q8NG80 312 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PIGXQ8TBF5 258 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 BADQ92934 168 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MOAP1Q96BY2 351 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 WACQ9BTA9 647 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM43Q9BTV4 400 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC38A1Q9H2H9 487 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 NTNG1Q9Y2I2 539 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CDH10Q9Y6N8 788 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0A6YYJ9 748 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINI2O75830 405 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 F3P13726 295 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 INPP1P49441 399 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GAS1P54826 345 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ST3GAL3Q11203 375 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FGL2Q14314 439 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GPR139Q6DWJ6 353 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ARSKQ6UWY0 536 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR2L3Q8NG85 312 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FGF11Q92914 225 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PIGUQ9H490 435 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF222Q9UK12 451 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ING4Q9UNL4 249 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CLCA2Q9UQC9 943 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 STON1Q9Y6Q2 735 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM129A0AVI4 362 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 STK25O00506 426 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GNSP15586 552 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PTNP21246 168 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM23P36406 574 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6V1E1P36543 226 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CD79BP40259 229 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CDH11P55287 796 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 BTN3A2P78410 334 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 LTB4RQ15722 352 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 STK11Q15831 433 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM81Q6P7N7 255 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GHDCQ8N2G8 530 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RIT1Q92963 219 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 COL26A1Q96A83 441 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OTULINQ96BN8 352 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ELP4Q96EB1 424 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL28Q9NXS3 571 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GPR89AB7ZAQ6 455 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms